Gestion des données
Dirigé par le Prof Issaka Sagara
Cette unité assure :
- La conception de base de données
- Essais vaccinaux
- Essais de médicaments
- Enquêtes
- La gestion des bases de données
- La collaboration avec d’autres institutions pour la gestion des données Muso, CICM, UCRS, IRSS Bobo, Manferinya (Guinée)
- La formation en gestion de données (ateliers et cours)
Logiciels et outils de gestion :
- Stata, SPSS, R etc
- Plates formes (collecte des données par tablettes)
- Share point
- Internet Connexion (Afribonne) depuis 2015
- Serveur de données (mrtc-data)
Organigramme de Gestion des données
Led by Pr. Doumbo Safiatou Niaré
Initiée depuis 2012, cette unité a vu le jour en 2020 à partir de la collaboration avec : CNAM, France, ESTHER (microsporidiose). Elle assure :
- L’établissement d’une collaboration avec les structures de santé et les laboratoires : appuis aux soins
- La Formation continue en mycologie: Thèses, présentations et des formations théoriques et pratiques en mycologie
- L’écriture et exécution régulière des Grants de recherche sur les champignons
- Le plateau technique : chaine de culture fongique et identification, Un incubateur, une hôte, 2 microscopes, une paillasse, des matériels de laboratoire et réactifs essentiels pour l’examen direct et la culture des champignons.
Dirigé par Pr. Boubacar Traoré / Dr Amatigué Ziguimé
Unité crée en 2001, le laboratoire Clinique permet d’établir des cadres de Bonnes Pratiques de Laboratoire (BPL) et de CLIA en biologie clinique (Establish GLP and CLIA in clinical biology areas):
- Hématologie
- Biochimie
- Parasitologie
- Sérologie / Immunologie
Le laboratoire clinique appuie les essais cliniques de vaccins et autres essais cliniques assurant l’évaluation de l’éligibilité des volontaires, la tolérance des vaccins, l’efficacité, l’immunogénicité des vaccins. Le laboratoire clinique a été accrédité en avril 2010, octobre 2014, octobre 2016, octobre 2018. Le plateau technique est fait de :
- Une machine d’hématologie (DxH500) et machine de biochimie (Pentra C 200) sur chaque site (maintenance / calibrations au moins deux fois par ans)
- Chaine de froid (chambre froide, congélateurs …)
- Système de gestion des échantillons / réactifs (fonctionnement des congélateurs (Freezer Work) et « Vaisala for Temp monitoring »)
- Machines pour ELISA et autres équipements (Maintenance / calibration, corrélation)
- Saisie des données à temps réel (Direct data entry) (iDataFax), suivi des valeurs anormales et autres
- En perspective: qPRC pour bientôt.
Organigramme du Laboratoire Clinique
Unité de diagnostic parasitaire
Dirigé par Prof Amagana Dolo / Prof Mouctar Diallo / Dr Abdoulaye Kassoum Koné
Créée en même temps que le Département d’Epidémiologie des Affections Parasitaires (DEAP); c’est la plus vieille unité du MRTC.
Elle a été mise en place pour assurer les missions suivantes :
- Assurer le contrôle de qualité du diagnostic des maladies parasitaires (services de soin, appui aux programmes de lutte, sites sentinelles – PMI)
- Initier les internes (médecine, pharmacie) aux techniques de base de parasitologie
- Assurer la formation du personnel (technicien, médecin,…..) aux techniques de diagnostic parasitaire
Les activités :
- Diagnostic des parasites sanguicoles,
- Diagnostic des parasites des selles,
- Opportunistes (cryptosporidies, isospores, microsporidies),
- Diagnostic des parasites des urines, diagnostic de parasites divers: onchocercose.
Organigramme
PREMA
Dirigé par Prof Boubacar Traoré / Prof Kassoum Kayentao
Cette unité a été créé formellement en 2006 à partir de l’équipe ayant travaillé sur le projet « IPTp-SP ou CQ versus CQ weekly » en 1998-2001 chez les femmes enceintes renforcée par le retour de Prof Boubacar Traoré en 2003.
Mission
- Contribution à l’évaluation et à la mise en œuvre des stratégies de prévention du paludisme au cours de la grossesse,
- Contribution à la compréhension de la physiopathologie du paludisme : immunologie de l’infection Placentaire,
- Contribution à la compréhension de l’acquisition de la réponse immunitaire au cours de l’infestation naturelle à P. Falciparum,
- Promotion de la formation dans les domaines de la parasitologie, l’immunologie parasitaire et en santé publique.
Organigramme du PREMA
Immunologie
Dirigé par le Prof Bourèma Kouriba
PACEMI travaille sur les thématiques de recherche suivantes :
- Immunologie des maladies parasitaires;
- Immunologie des pathologies virales émergentes et re-émergentes;
- Génétique des maladies parasitaires;
Plateau technique : Chaine ELISA, Plateforme Microarray, Plateforme culture cellulaire, Chaine d’azote liquide
Personnel
- Pr Bourèma Kouriba PharmD, MSc, PhD, Maître de Conférence Agrégé du CAMES, Chef d’Unité, Enseignant-Chercheur, USTTB, Ministère de la Santé
- Dr Charles Arama PharmD, MSc, PhD, Chargé de la Recherche, Maître-Assistant CAMES, USTTB, Ministère de la Santé
- Dr Issa Diarra PharmD, MSc, Attaché de Recherche, USTTB, Ministère de la Santé
- Dr Karamoko Niaré PharmD, MSc, PhD Candidate, en formation au KEMRI, Kenya et WACCIP, Ghana
- Dr Amatigue Zeguimé PharmD
- M. S. Yirampo MSc, Investigateur
- Dr K. Bangaly PharmD, MSc candidate, investigateur et équipe de vaccination
- Dr H. Doucouré PharmD, Investigateur
- M. B. Koné PharmD candidate
- Me. O. Sissoko PharmD candidate
Schistosomiase
Dirigé par le Pr. Abdoulaye Dabo
Le DEAP est un Centre Collaborateur de l’OMS pour les schistosomiases depuis 1987. La création UFR Schistosomoses et Mollusques hôtes intermédiaires a été créée en 1995. L’unité a comme mission :
- Générer des résultats de recherche sur les schistosomoses, les helminthiases et les mollusques hôtes intermédiaires utilisables pour les prises de décisions éclairées en santé publique ;
- Tester des stratégies de lutte efficientes et généralisables contre les schistosomoses, les helminthiases et les mollusques hôtes intermédiaires ;
- Renforcer le potentiel de formation (internes, stagiaires, assistants, thésards), et de recherche (Masters et PhD) des apprenants que reçoit le MRTC/DEAP/FMPOS.
Vaccins
Dirigé par le Prof Issaga Sagara
MEDRU
Dirigé par Pr. Abdoulaye DJIMDE
Les laboratoires et leur rôle au sein de l’organisation mère
Les laboratoires MEDRU font partie du MRTC/DEAP et sont en activité depuis 2001.
Une compréhension approfondie des objectifs de notre laboratoire pour nos employés est essentielle. Nous formons, actualisons et engageons en permanence les employés en fonction de notre mission et des services que nous fournissons à nos partenaires. Nous évaluons les capacités et l’expertise de nos ressources humaines (RH) et de nos employés à la lumière de nos missions et des objectifs et exigences de nos partenaires.
A chaque activité spécifique, des personnes appropriées sont désignées pour mener à bien cette tâche. Les personnes désignées assureront la gestion des besoins en réactifs, consommables, les stocks et les commandes. Ces personnes assurent le traitement des échantillons, la collecte, l’analyse des données et l’élaboration du rapport d’étude. La gestion des données comprend l’approbation du protocole, l’archivage des cahiers d’observation et des supports électroniques de manière à assurer l’exactitude des données et à éviter les biais. Les données sont sauvegardées dans le laboratoire de PCR et aussi sauvegardées sur le serveur DELGEME par notre responsable informatique. L’accès aux données est limité aux employés et aux partenaires si nécessaires.
L’accès aux échantillons et aux données est restreint aux personnels habilités (Confidentialité élevée, protection par mot de passe, verrouillage des archives, restriction d’accès aux données). Le gestionnaire des laboratoires MEDRU/MRTC/DEAP travaille en concert avec les personnes désignées pour évaluer régulièrement notre fonctionnement et prendre des mesures correctives afin de garantir de bonnes performances à chaque étape des procédures.
- Les missions de nos laboratoires sont :
- Recherches fondamentales et appliquées (Le laboratoire principal MEDRU/MRTC/DEAP- Point-G et le laboratoire de Sotuba)
- Découverte de médicaments
- Résistance aux médicaments
- Biologie Cellulaire
- Génomique et Bioinformatique
- Pharmacologie [PD, PK, PG]
- Nutrition
- Entomologie
- Recherches cliniques (Laboratoire MEDRU/MRTC/DEAP-Sotuba, Bougoula, Kolle, Djoliba, Faladie)
- Essais Cliniques
- Etudes observation sur le terrain
- Design des études
- Monitorage Interne
- Services aux partenaires et clients (Le laboratoire principal MEDRU/MRTC/DEAP- Point-G et le laboratoire de Sotuba)
- Gestion des Echantillons
- Analyse des Echantillons
- Rédaction des rapports
- Gestion et partage des données (Le laboratoire principal MEDRU/MRTC/DEAP- Point-G et le laboratoire de Sotuba)
- Commission scientifique (Tous les laboratoires MEDRU/MRTC/DEAP)
- Recherche d’opportunités de financement
- Écritures Scientifiques et Valorisation de la Recherche
- Formations
- Recherches fondamentales et appliquées (Le laboratoire principal MEDRU/MRTC/DEAP- Point-G et le laboratoire de Sotuba)
- Activités et services des laboratoires
Pour l’atteinte de ses objectifs, les laboratoires MEDRU disposent des plateformes suivantes :- Essais cliniques: (Les sites MEDRU/MRTC/DEAP- de Bougoula, Djoliba, Faladie, Kolle, Sotuba) La Polymerase Chain Reaction (PCR) classique et la PCR quantitative pour le diagnostic moléculaire (Le laboratoire principal MEDRU/MRTC/DEAP- Point-G et le laboratoire de Sotuba)
- Les machines de biochimie et d’hématologie de pointe sont utilisées pour doser les paramètres suivants : ALAT, ASAT, Glucose, les bilirubines Totale et Directe, la Créatinine, les ions (potassium, chlore, calcium, magnésium), la numération formule sanguine (Les laboratoires MEDRU/MRTC/DEAP de Bougoula, Kolle et Sotuba)
- Les cultures cellulaires sont menées pour comprendre le mécanisme de résistance in vitro/ex vivo et pour le screening des nouveaux médicaments (Le laboratoire principal MEDRU/MRTC/DEAP- Point-G). Insectarium (Les captures des vecteurs et infestations expérimentales sont effectuées pour évaluer les paramètres liés à la transmission en collaboration avec nos collègues entomologistes). (Le laboratoire principal MEDRU/MRTC/DEAP- Point-G et le laboratoire de Bougoula)
- Les machines de Chromatographie Liquide à Haute Performance (HPLC) sont utilisées pour le dosage des médicaments et leurs métabolites (Le laboratoire principal MEDRU/MRTC/DEAP- Point-G). Impédancemètre et FTIR pour l’évaluation de l’état nutritionnel (Le laboratoire principal MEDRU/MRTC/DEAP- Point-G)
- Une plateforme pour le séquençage à haut débit (Le laboratoire principal MEDRU/MRTC/DEAP- Point-G)
Organigramme
Antoine Dara
Je suis professeur associé de biologie moléculaire et de bioinformatique à l’Université des Sciences, Techniques et Technologies de Bamako, au Mali. Mes recherches portent sur l’étude des interactions parasite-hôte du paludisme, les mécanismes moléculaires de la pathogenèse, la résistance aux antipaludiques et la dynamique de transmission des agents pathogènes, à l’aide d’approches génomiques et bioinformatiques de pointe intégrées. Je contribue aux efforts de compréhension de la résistance à l’artémisinine en Afrique grâce à la multi-omique (génomique, transcriptomique, protéomique), afin d’éclairer de nouvelles stratégies thérapeutiques. Au fil des années, j’ai acquis une solide expertise en analyse de données omiques (maîtrise de la bioinformatique avec Linux, Python, R, Perl et scripts Bash) et encadré de nombreux étudiants et chercheurs en début de carrière. Actuellement responsable du laboratoire de génomique du Centre de recherche et de formation sur les parasites et les microbes, je coordonne les efforts de séquençage des parasites du paludisme et des agents pathogènes émergents. J’enseigne à la Faculté de Pharmacie (étudiants en pharmacie et en master) et au Centre Africain d’Excellence en Bioinformatique (ACE-B). Je suis un ancien élève du programme de bourses postdoctorales DELGEME et actuellement un Aspirant Leader de ce même programme.
Publications scientifique :
https://orcid.org/0000-0002-7739-4437
https://antonydara.github.io/
Laurent Dembelé
Dr Laurent Dembélé a obtenu son diplôme d’ingénieur (Bac+5) ainsi qu’un master en ingénierie en biotechnologie et microbiologie. Il a débuté sa carrière de chercheur en 2009 en tant que doctorant à l’Université Pierre et Marie Curie, France (Université Paris 6). Ses premiers travaux de recherche portaient sur le développement d’un modèle in vitro pour la découverte de médicaments ciblant le stade hépatique des formes récidivantes du paludisme.
Après son doctorat, le Professeur Laurent Dembélé a rejoint le Novartis Institute for Tropical Diseases, où il a élargi ses travaux de recherche en se concentrant sur la biologie du stade hépatique du Plasmodium, la découverte de médicaments, ainsi que la résistance du parasite aux traitements. Après cinq années passées dans l’industrie pharmaceutique chez Novartis, il a décidé de retourner dans son pays, le Mali, pour occuper un poste académique permanent au sein de l’Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB).
Actuellement, le Dr Laurent Dembélé est Professeur associé et dirige les activités de découverte de médicaments au Centre de Recherche et de Formation sur les Parasites et les Microbes (PMRTC) de l’USTTB. Ses recherches portent sur le paludisme à Plasmodium falciparum et les espèces non-falciparum, la biologie des stades hépatiques et sanguins du parasite, la découverte de médicaments, la pharmacologie et la résistance aux traitements. Le Professeur Dembélé s’intéresse également à la schistosomiase, notamment à son épidémiologie, l’hybridation, la biologie et la découverte de nouveaux traitements.
Abdoulaye Djimdé
Abdoulaye Djimdé a obtenu un doctorat en pharmacie de l’École nationale de médecine et de pharmacie de Bamako (Mali) en 1988 et un doctorat en microbiologie et immunologie de l’Université du Maryland à Baltimore (Maryland, États-Unis) en 2001 et est Professeur de parasitologie-mycologie.
Il est actuellement Directeur du MRTC-Parasito, chef de l’unité d’épidémiologie moléculaire et de pharmacorésistance du Centre de recherche et de formation sur le paludisme de l'Université des sciences, techniques et technologies de Bamako, au Mali.
L’objectif principal de ses recherches est de comprendre comment le parasite du paludisme devient résistant aux antipaludiques et comment cette résistance se propage dans le temps et dans l’espace. Avec son équipe et ses collaborateurs, il mène des analyses sur le terrain et en laboratoire afin d’expliquer comment les événements génétiques du parasite du paludisme, de l’hôte humain et du génome du vecteur moustique sont liés au résultat du traitement et à la propagation de la résistance aux médicaments.
Outre ses propres recherches, il a joué un rôle déterminant dans la création du Réseau mondial de lutte contre les antipaludiques et a siégé à son conseil consultatif scientifique pendant plusieurs années. Il a été nommé président du groupe de travail sur l'Initiative multilatérale sur le paludisme au sein de l'OMS-TDR. En 2009, il a été nommé l'un des deux membres internationaux du Wellcome Trust Sanger Institute.
Il est actuellement coordinateur du réseau ouest-africain d’essais cliniques sur les médicaments antipaludéens (WANECAM, www.wanecam.org) et responsable du réseau de diversité du Plasmodium en Afrique (PDNA). Il est président fondateur de l’Association africaine pour la recherche et le contrôle de la résistance aux antimicrobiens (AAAMR, www.africaamr.org) et Directeur du Développement de l’Excellence en Leadership pour l’Élimination du Paludisme en
Afrique sub-Saharienne (DELGEME, www.delgeme.org).
Il est auteur de 146 Publications scientifiques.
Liste des publications: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Djimde+a.%2C
Profil LinkedIn: https://www.linkedin.com/in/abdoulaye-djimde-6b983173/
Profil Research Gate: https://www.researchgate.net/profile/Abdoulaye_Djimde
Les réalisations du Directeur: https://www.youtube.com/watch?v=8rthby3JJ4A
Souleymane Dama
Aminatou Koné
Dinkorma T. Ouologuem
Mamadou Téketé
Laurent Dembelé
Dr Laurent Dembélé a obtenu son diplôme d’ingénieur (Bac+5) ainsi qu’un master en ingénierie en biotechnologie et microbiologie. Il a débuté sa carrière de chercheur en 2009 en tant que doctorant à l’Université Pierre et Marie Curie, France (Université Paris 6). Ses premiers travaux de recherche portaient sur le développement d’un modèle in vitro pour la découverte de médicaments ciblant le stade hépatique des formes récidivantes du paludisme.
Après son doctorat, le Professeur Laurent Dembélé a rejoint le Novartis Institute for Tropical Diseases, où il a élargi ses travaux de recherche en se concentrant sur la biologie du stade hépatique du Plasmodium, la découverte de médicaments, ainsi que la résistance du parasite aux traitements. Après cinq années passées dans l’industrie pharmaceutique chez Novartis, il a décidé de retourner dans son pays, le Mali, pour occuper un poste académique permanent au sein de l’Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB).
Actuellement, le Dr Laurent Dembélé est Professeur associé et dirige les activités de découverte de médicaments au Centre de Recherche et de Formation sur les Parasites et les Microbes (PMRTC) de l’USTTB. Ses recherches portent sur le paludisme à Plasmodium falciparum et les espèces non-falciparum, la biologie des stades hépatiques et sanguins du parasite, la découverte de médicaments, la pharmacologie et la résistance aux traitements. Le Professeur Dembélé s’intéresse également à la schistosomiase, notamment à son épidémiologie, l’hybridation, la biologie et la découverte de nouveaux traitements.
Aminatou Koné
Lead
Résistance aux médicaments
Laurent Dembelé
Lead
Découverte de médicaments
Dr Laurent Dembélé a obtenu son diplôme d’ingénieur (Bac+5) ainsi qu’un master en ingénierie en biotechnologie et microbiologie. Il a débuté sa carrière de chercheur en 2009 en tant que doctorant à l’Université Pierre et Marie Curie, France (Université Paris 6). Ses premiers travaux de recherche portaient sur le développement d’un modèle in vitro pour la découverte de médicaments ciblant le stade hépatique des formes récidivantes du paludisme.
Après son doctorat, le Professeur Laurent Dembélé a rejoint le Novartis Institute for Tropical Diseases, où il a élargi ses travaux de recherche en se concentrant sur la biologie du stade hépatique du Plasmodium, la découverte de médicaments, ainsi que la résistance du parasite aux traitements. Après cinq années passées dans l’industrie pharmaceutique chez Novartis, il a décidé de retourner dans son pays, le Mali, pour occuper un poste académique permanent au sein de l’Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB).
Actuellement, le Dr Laurent Dembélé est Professeur associé et dirige les activités de découverte de médicaments au Centre de Recherche et de Formation sur les Parasites et les Microbes (PMRTC) de l’USTTB. Ses recherches portent sur le paludisme à Plasmodium falciparum et les espèces non-falciparum, la biologie des stades hépatiques et sanguins du parasite, la découverte de médicaments, la pharmacologie et la résistance aux traitements. Le Professeur Dembélé s’intéresse également à la schistosomiase, notamment à son épidémiologie, l’hybridation, la biologie et la découverte de nouveaux traitements.
Dinkorma T. Ouologuem
Lead
Biologie cellulaire
Parcours
- PharmD, PhD, MCA en biologie cellulaire
- Faculté de Pharmacie (FAPH)
- Université des Sciences, Techniques et Technologies de Bamako (USTTB)
- P.O. Box: 1805 Point G, Bamako; Mali (Afrique de l’Ouest)
Contact
Bio
Dinkorma Ouologuem Toure,
Maître de conférences à la Faculté de Pharmacie (FAPH) de l’Université des Sciences, des Techniques et Technologies de Bamako (USTTB), Mali ; Chercheuse au Centre de Recherche et de Formation sur les Parasites et les Microbes (P-MRTC)
Dinkorma Touré Ouologuem est maître de conférences à la Faculté de Pharmacie de Bamako et chercheuse au Centre de Recherche et de Formation sur les Parasites et les Microbes du Mali (P-MRTC). Son parcours universitaire a débuté par un baccalauréat au Gabon (1996), suivi d’un doctorat en pharmacie à l’École de Pharmacie de Bamako en 2004. Elle a ensuite poursuivi ses études supérieures aux États-Unis, où elle a obtenu une maîtrise (2011) et un doctorat (2014) en biologie cellulaire à l’Université de Pennsylvanie. Son expertise lui a valu d’être recrutée comme Assistant à la Faculté de Pharmacie, et elle a été promue professeure agrégée en 2024 suite à sa réussite au concours d’agrégation du CAMES (Conseil Africain et Malgache pour l’Enseignement Supérieur).
Les recherches novatrices du Dr Ouologuem portent sur la transmission du paludisme, et plus particulièrement sur l’utilisation d’isolats de terrain pour identifier de nouvelles cibles thérapeutiques et diagnostiques. En analysant les parasites du Plasmodium circulant au Mali et des séra de partients maliens et en utilisant la génomique comparative, elle a identifié des gènes du parasite associés à la transmission du paludisme aux moustiques vecteurs. Ces travaux ont des implications importantes, révélant des biomarqueurs potentiels de l’infectiosité parasitaire et des candidats prometteurs pour le développement de thérapies bloquant la transmission.
Dans le cadre d’une innovation majeure, le Dr Ouologuem a optimisé les conditions de culture cellulaire pour conserver des gamétocytes (qui sont la seule forme du parasite assurant l’infection chez le moustique) prélevés directement sur des patients atteints de paludisme afin d’évaluer l’activité des médicaments. Ce protocole ex vivo simplifie considérablement le processus de développement de médicaments, économisant des semaines de travail en laboratoire et, surtout, permettant l’évaluation d’isolats de parasites circulant dans des régions d’endémie palustre, difficiles à adapter en laboratoire. Cette capacité permet d’évaluer la sensibilité des parasites circulants beaucoup plus tôt dans les études précliniques.
De plus, le Dr Ouologuem est un chercheur clé du consortium Malaria du programme Grand Challenges African Drug Discovery Accelerator (GC-ADDA). Cette initiative essentielle vise à développer des médicaments multi-étapes qui non seulement traitent le paludisme, mais bloquent également activement sa transmission, contribuant ainsi à l’objectif ultime d’élimination et d’éradication de la maladie.
Au-delà de ses recherches, le Dr Ouologuem est profondément engagé dans l’éducation. Elle enseigne la biologie cellulaire fondamentale et la parasitologie moléculaire au premier cycle, s’efforçant de souligner l’importance capitale de la biologie cellulaire pour les étudiants maliens, notamment compte tenu de la richesse des opportunités de recherche translationnelle et scientifiquement pertinentes offertes au Mali.
Aoua Coulibaly
Lead
Génomique et bio-informatique
Mamadou Tekete
Lead
Pharmacologie
Bakary Fofana
Lead
Bio
Aliou Traoré
Adjoint
Mamadou Téketé
Lead
Laurent Dembelé
Adjoint
Dr Laurent Dembélé a obtenu son diplôme d’ingénieur (Bac+5) ainsi qu’un master en ingénierie en biotechnologie et microbiologie. Il a débuté sa carrière de chercheur en 2009 en tant que doctorant à l’Université Pierre et Marie Curie, France (Université Paris 6). Ses premiers travaux de recherche portaient sur le développement d’un modèle in vitro pour la découverte de médicaments ciblant le stade hépatique des formes récidivantes du paludisme.
Après son doctorat, le Professeur Laurent Dembélé a rejoint le Novartis Institute for Tropical Diseases, où il a élargi ses travaux de recherche en se concentrant sur la biologie du stade hépatique du Plasmodium, la découverte de médicaments, ainsi que la résistance du parasite aux traitements. Après cinq années passées dans l’industrie pharmaceutique chez Novartis, il a décidé de retourner dans son pays, le Mali, pour occuper un poste académique permanent au sein de l’Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB).
Actuellement, le Dr Laurent Dembélé est Professeur associé et dirige les activités de découverte de médicaments au Centre de Recherche et de Formation sur les Parasites et les Microbes (PMRTC) de l’USTTB. Ses recherches portent sur le paludisme à Plasmodium falciparum et les espèces non-falciparum, la biologie des stades hépatiques et sanguins du parasite, la découverte de médicaments, la pharmacologie et la résistance aux traitements. Le Professeur Dembélé s’intéresse également à la schistosomiase, notamment à son épidémiologie, l’hybridation, la biologie et la découverte de nouveaux traitements.
Nouhoum Diallo
Adjoint
Unité: « Ouelessebougou Clinical Research Unit »
Dirigé par le Prof Alassane Dicko
Bref historique :
- Epidemiology Biostatistics and Data Management Unit (2001 –
- Préparation de sites pour les tests des vaccins antipaludiques (1998-2003)
- Test des vaccins antipaludiques du MVDB (ancien LMIV) : Doneguebougou, Bancoumana
- 2007: Retrait stratégique des essais de vaccins et des programmes NIAID pour le développement de nouveau site à Ouelessebougou
- 2008: Ouelessebougou Clinical Research Unit.
Malaria Vaccine Clinical Development Unit (MVCDU) / Bandiagara Malaria Project (BMP)
Dirigé par le Prof Mahamadou A Thera
Le projet de lutte contre le paludisme de Bandiagara, une collaboration soutenue par le NIH entre le MRTC et le Center for Vaccine Development de l’Université du Maryland, a été lancé en 1998. Depuis ses débuts, la BMP a été constamment développée avec des fonds provenant de sources externes concurrentielles. Le NIH International Collaboration for Infectious Disease Research (ICIDR) a apporté son soutien jusqu’en 2015. L’USAID (renforcement de l’infrastructure du site et essais cliniques), le Fogarty International Centre (FIC, formation en recherche), le MCTA (renforcement de l’infrastructure du site), l’AMANET (essai de vaccin), l’OMS/TDR (études épidémiologiques), le Wellcome Trust (résistance aux médicaments et études épidémiologiques génétiques). Les chercheurs de BMP et leurs collaborateurs ont été capables de gagner constamment des prix et des subventions depuis 1998.
De nombreuses études épidémiologiques ont été menées.
2008, le centre de recherche BMP a été reconnu comme une structure d’utilité publique et les autorités administratives de la région de Mopti ont décidé de soutenir l’approvisionnement en électricité et en eau.
2003-2016 : Six essais cliniques de vaccins contre le paludisme.
Missions :
- Caractériser l’épidémiologie du paludisme
- Réaliser des essais cliniques de vaccins et de médicaments antipaludiques, selon le standard ICH/GCPs
- Renforcer les capacités du Centre de Santé de Référence du district de Bandiagara
- Site sentinelle du PNLP de surveillance de la résistance aux antipaludiques
- Contribuer aux missions en général du DEAP/MRTC.
Under the leadership of Pr Mahamadou A. Thera, BMP has developed to become a whole research structure with a well-established research center in the field in Bandiagara and a Clinical Trial Center in Bamako, Point G.
Prof Thera is seconded by Dr Drissa Coulibaly, Pr Abdoulaye K Kone and Pr Karim Traore, the senior researchers, a team of twelve junior scientists and fourteen support personnel.
Leadership
Mahamadou A Thera
Biosketch
Mahamadou A Thera, MD, MPH, PhD, FAAS, is the Scientific Director of the Bandiagara Malaria Program (BMP) at the Malaria Research and Training (MRTC) of the University of Sciences, Techniques and Technologies of Bamako, in Mali. Since 2008, he is Professor of Parasitology-Mycology at the Faculty of Medicine and Odonto-Stomatology of Bamako.
He was principal investigator of several clinical trials that assessed blood-stage malaria vaccine candidates and malaria drugs. His group established for the first time, proof of concept of the allele specific protective efficacy of a blood-stage malaria vaccine against clinical malaria in a malaria endemic country. Pr Thera also directed several epidemiological studies of malaria in Mali.
He has been member of several scientific advisory committees including the WHO advisory body for malaria vaccines MALVAC and JTEG, the European Vaccine Initiative Scientific Advisory Committee (EVI-SAC), that he chaired during the period 2015-2017. He has co-authored more than 110 manuscripts indexed in PubMed.
Pr Thera holds a MD from the Institute of Medicine and Pharmacy of Jassy, (Romania, 1986), a MPH from University of Bamako (Mali, 1996), a MSc in Biostatistics and Conduct of Clinical Trials from University of Paris 6 (France, 2003) and a PhD in Parasitology-Mycology from University of Bamako’s Institute of Training and Applied Research (ISFRA) (Mali, 2015).
Dr Thera was in 2000, the first Fellow of the WHO/TDR Clinical Research and Development Fellowship, initially supported by Glaxo SmithKline Biologicals and TDR. This fellowship turned into a successful capacity building program in Clinical research and product development for developing countries, thanks to substantial funding received from the Gates Foundation and EDCTP.
As Professor at the FMOS, Pr Thera contribute to train undergraduate MDs, and PharmDs, post graduate MSc and PhD students, in Mali and in the neighboring countries.
Pr Thera is member of the Académie des Sciences du Mali (ASM) since 2018 and a Fellow of the African Academy of Sciences since 2020.
Dr Thera’s areas of expertise include malaria epidemiology, malaria pathogenesis, clinical trials, product clinical research and development, ethics, parasitic diseases.
Actual work
Has two main directions. First direction addresses issues related to human host-malaria parasites interactions. It focuses on understanding the role of variant PfEMP1s antigens in the pathogenesis of severe malaria, either cerebral malaria or severe malaria anemia. This is done by analyzing seroreactivity profiles to microarrays of antigens printed on slides, of children aged under five years in a case-control study of severe malaria. This project was supported by the NIH R01AI099628, awarded to Prof Thera in 2014-2020. The second direction of work is focused on the clinical development vaccines against malaria and viral infections. The malaria vaccine candidate derived from P. falciparum merozoite surface protein 3, the MSP3-CRM candidate manufactured by Vac-4-All is being tested in a series of clinical trials to demonstrate the proof of concept of its safety, immunogenicity and efficacy against clinical malaria.
Selected publications
(List of Published Work in MyBibliography: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/myncbi/1VMcnFoclLkks/bibliography/public/)
- Thera MA, Kone AK, Tangara B, Diarra E, et al., School-aged children based seasonal malaria chemoprevention using artesunate-amodiaquine in Mali. Parasite Epidemiology and Control. 2018. doi.org/10.1016/j.parepi.2018.02.001
- Djimde A, Ranque S, Thera MA. Building a center of excellence in biomedical research in an unfavorable environment: the Malaria Research and Training Center in Mali. Med Sante Trop. 2019. doi: 10.1684/mst.2019.0938. PubMed PMID: 31884979.
- Malaria Genomic Epidemiology Network, Band G, Rockett KA, Spencer CC, Kwiatkowski DP. A novel locus of resistance to severe malaria in a region of ancient balancing selection. Nature. 2015. doi:10.1038/nature15390.
- Thera MA, Doumbo OK, Coulibaly D, Plowe CV et al., A field trial to assess a blood-stage malaria vaccine. N Engl J Med. 2011. doi: 10.1056/NEJMoa1008115.
- Tishkoff SA, Reed FA, Friedlander FR, Ehret C, Thera MA, Wambebe C, Weber JL, Williams SM et al., The genetic structure and history of Africans and African Americans. 2009. doi:10.1126/science.1172257.
Dr Drissa Coulibaly
Biosketch
Drissa Coulibaly is a physician and specialist in parasitology with extensive experience in pediatric studies in Mali, particularly Bandiagara. He conducted multiple malaria epidemiology studies in over the past two decades, including cross-sectional surveys, case-control studies, and longitudinal cohort studies. He was involved in developing Bandiagara as a malaria vaccine testing site in Mali since 1998 and has led multiple NIAID-sponsored studies there. He has expertise in the implementation of malaria vaccine clinical trials according to international standards. He successfully conducted Phase 1 and Phase 2 clinical trials using candidates malaria vaccines based on MSP1 and AMA1 antigens and whole organism sporozoite-based malaria vaccine in Mali. He has been a faculty member for workshops on malaria case management for National Malaria Control Program staff and the health service providers in Mali. He led a five-year malaria incidence study in children in Bandiagara from 2009 to 2014 including geographic information systems-based analyses identifying parasite reservoirs in the community.
Actual work
Currently, Dr Coulibaly is leading: i) a five year incidence study supported by the NIH R01 5R01AI150534, awarded to Dr Coulibaly in 2021-2026, ii) a study of P. vivax infection in Duffy-negative erythrocyte supported by the Laboratory of Malaria and Vector Research (LMVR) National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)/NIH, iii) a Phase 1a clinical trial of malaria vaccine candidate derived from P. falciparum merozoite surface protein 3 associated with CRM manufactured by Vac-4-All.
Selected publications
- Coulibaly D, Guindo B, Niangaly A, Maiga F, Konate S, Kodio A et al., A Decline and Age Shift in Malaria Incidence in Rural Mali following Implementation of Seasonal Malaria Chemoprevention and Indoor Residual Spraying. Am J Trop Med Hyg. 2021 Mar 1: tpmd200622. doi: 10.4269/ajtmh.20-0622.
- Coulibaly D, Travassos MA, Tolo Y, et al. Spatio-Temporal Dynamics of Asymptomatic Malaria: Bridging the Gap Between Annual Malaria Resurgences in a Sahelian Environment. Am J Trop Med Hyg. 2017 Dec;97(6):1761-1769. PMID:29141722
- Noor AM, Kibuchi E, Mitto B, Coulibaly D, Doumbo OK, Snow RW. Sub-National Targeting of Seasonal Malaria Chemoprevention in the Sahelian Countries of the Nouakchott Initiative. PLoS One. 2015 Aug 31;10(8):e0136919. doi: 10.1371/journal.pone.0136919. eCollection 2015. Erratum in: PLoS One. 2015;10(10):e0140414. PubMed PMID: 26322634
- Thera MA, Doumbo OK, Coulibaly D, Plowe CV et al., A field trial to assess a blood-stage malaria vaccine. N Engl J Med. 2011. doi: 10.1056/NEJMoa1008115.
- Agarwal A, Guindo A, Cissoko Y, Taylor JG, Coulibaly D et al., Hemoglobin C associated with protection from severe malaria in the Dogon of Mali, a West African population with a low prevalence of hemoglobin S. Blood. 2000 Oct1;96(7):2358-63. PubMed PMID: 11001883.
Pr Abdoulaye K Kone
Biosketch
Abdoulaye Kassoum Koné, MD, MPH, PhD, is a senior scientist of the Bandiagara Malaria Program (BMP) at the Malaria Research and Training (MRTC) of the University of Sciences, Techniques and Technologies of Bamako, in Mali. He is Associate Professor of Parasitology-Mycology at the Faculty of Medicine and Odonto-Stomatology of Bamako. He has an expertise in severe malaria diagnosis, management and recognizing the ophthalmologic manifestations such as retinopathy in Malian children with cerebral malaria. Dr Kone serves as clinical investigator, clinical coordinator, and principal investigator in the NIH-NIAID sponsored Bandiagara Malaria Project. He draws from a decade of experience in clinical malaria studies including epidemiological and clinical trials. Since 2010 Dr Kone works on cutaneous leishmaniasis epidemiology focused on diagnosis, clinical description, Leishmania species and vectors identification. As Associate Professor at the FMOS, Dr Kone contribute to train undergraduate MDs, and PharmDs, MSc and PhD candidates in Mali.
Dr Kone areas of expertise include malaria epidemiology, clinical trials, Leishmaniasis epidemiology, parasitic diseases and vectors.
Actual work
Is centered on three topics. First topic is leishmaniasis epidemiology. It focuses on clinical presentation, hosts, Leishmania species and Phlebotomus species interactions in Mali. This was done through an investigation of outbreak of cutaneous leishmaniasis in dogon country. This project was supported by the ministry of health in Mali. The second topic of work is on the clinical development of vaccines against malaria and viral infections. The malaria vaccine candidate, the MSP3-CRM candidate manufactured by Vac-4-All is being tested in a series of clinical trials to demonstrate the proof of concept of its safety, immunogenicity and efficacy against clinical malaria. The third topic is on hospital-based epidemiological studies of fungal diseases such as Aspergillosis and Histoplasmosis.
Selected publications
- Kone AK, Niaré DS, Piarroux M, Izri A, Marty P, Laurens MB, Piarroux R, Thera MA, Doumbo OK. Visceral Leishmaniasis in West Africa: Clinical Characteristics, Vectors, and Reservoirs J Parasitol Res. 2019 Sep 2; 2019:9282690. doi: 10.1155/2019/9282690. eCollection 2019. Review. PMID: 31565426
- Kodio A, Coulibaly D, Koné AK, Konaté S, Doumbo S, Guindo A, Bittar F, Gouriet F, Raoult D, Thera MA, Ranque S. Blastocystis Colonization Is Associated with Increased Diversity and Altered Gut Bacterial Communities in Healthy Malian Children. Microorganisms. 2019 Dec 4;7(12). pii: E649. doi: 10.3390/microorganisms7120649. PMID: 31817168
- Kané B, Diallo KW, Koné AK, Simaga T, Koné O, Traoré A, Dicko FT. Paludisme grave chez un nouveau-né prématuré à l’unité de néonatologie de l’Hôpital du Mali. Rev Mali Infect Microbiol 2020, Tome 15 : 69-71
- Ouattara A, Niangaly A, Adams M, Coulibaly D, Kone AK, Traore K, Laurens MB, Tolo Y, Kouriba B, Diallo DA, Doumbo OK, Plowe CV, Djimdé A, Thera MA, Laufer MK, Takala-Harrison S, Silva JC. Epitope-based sieve analysis of Plasmodium falciparum sequences from a FMP2.1/AS02A vaccine trial is consistent with differential vaccine efficacy against immunologically relevant AMA1 variants. Vaccine. 2020 Jul 31;38(35):5700-5706. doi: 10.1016/j.vaccine.2020.06.035. Epub 2020 Jun 20.
- Bogale HN, Cannon MV, Keita K, Camara D, Barry Y, Keita M, Coulibaly D, Kone AK, Doumbo OK, Thera MA, Plowe CV, Travassos M, Irish S, Serre D. Relative contributions of various endogenous and exogenous factors to the mosquito microbiota. Parasit Vectors. 2020 Dec 10;13(1):619. doi: 10.1186/s13071-020-04491-7.
- Nabet C, Kone AK, Dia AK, Sylla M, Gautier M, Yattara M, Thera MA, Faye O, Braack L, Manguin S, Beavogui AH, Doumbo O, Gay F, Piarroux R. New assessment of Anopheles vector species identification using MALDI-TOF MS. Malar J. 2021 Jan 9;20(1):33. doi: 10.1186/s12936-020-03557-2.
Dr Karim Traore
Biosketch
Dr Karim Traore is a medical doctor with a PhD degree in biology, he is also a specialist in infectious diseases and anthropology. Dr Traore is a senior scientist of Bandiagara Malaria project at Malaria research and training center, faculty of medicine and dentistry of Mali. Since 2003, Dr Traore is involved in malaria clinical trials for vaccine and drug development, and epidemiological studies in both adult and children. The area of expertise of Dr Traore include epigenetics, interaction of environment and human genetic in susceptibility to infectious diseases. As senior researcher, Dr Traore is also involved in teaching parasitology and mycology, and ethics at the university of Sciences, Techniques, and Technologies of Bamako, and the training of MDs and master’s degree students. Dr Traore has been the coordinator of an ethic consortium involving Mali, Ghana, Guinea, and the catholic university of Lyon in France funded by EDCTP. Une image contenant personne, complet, homme, souriant Description générée automatiquement
Dr Traore earned his MD degree at the school of medicine and pharmacy of Mali in 2002, then successively completed a master’s degree in anthropo-biology, a diploma of specialization (DES) in infectious diseases at the university Cheick Anta Diop of Dakar in Senegal in 2011 and 2012, and a PhD degree at the university of Lyon, France in 2018. Since 2020 Dr Traore is an EDCTP senior fellow.
Actual work
The current work of Dr Traore include:
Senior fellowship of EDCTP funded program on research capacity development (TMA2018SF-2471), 2020-24. Under this senior fellowship, Dr Traore is conducting a clinical trial to evaluate the safety and efficacy of dihydroartemisinine plus piperaquine compared to sulfadoxine pyrimethamine in malaria chemoprevention in school-aged children in Bandiagara. Senior fellowship also includes the training and mentoring of MD candidate, master and PhD students.
Clinical coordinator of a phase 1a malaria vaccine trial testing a vaccine candidate derived from P. falciparum merozoite surface protein 3 associated with CRM manufactured by Vac-4-All from 2021 to present.
Co-investigator of pediatric malaria incidence studies from 2021 to present.
Clinical Monitor of clinical trials and epidemiological studies being conducted or coordinated by MRTC
Teaching parasitology -mycology, and ethics
Selected publications
- Traore K, Konate S, Thera MA, Niangaly A, Ba A, Niare A, Di Cristofaro J, Baby M, Picot S, Chiaroni J, Boetsch G, Doumbo OK. (2019) Genetic polymorphisms with erythrocyte traits in malaria endemic areas of Mali. PLoS ONE.2019; 14(1): e0209966.
- Traore K, Thera MA, Bienvenu A-L, Arama C, Bonnot G, Lavoignat A, Doumbo OK, Picot S. Interaction between environment, nutrient-derived metabolites, and immunity: A possible role in malaria susceptibility/resistance in Fulani and Dogon of Mali. PLOS ONE. 2017;12(12):e0189724.
- Maiga H, Grivoyannis A, Sagara I, Traore K, Traore OB, Tolo Y, Traore A, Bamadio A, Traore ZI, Sanogo K, Doumbo OK, Plowe CV, Djimde AA. Selection of pfcrt K76 and pfmdr1 N86 Coding Alleles after Uncomplicated Malaria Treatment by Artemether-Lumefantrine in Mali. Int J Mol Sci. 2021 Jun 3;22(11):6057. doi: 10.3390/ijms22116057. PMID: 34205228; PMCID: PMC8200001.
- Thomson-Luque R, Votborg-Novél L, Ndovie W, et al. Plasmodium falciparum transcription in different clinical presentations of malaria associates with circulation time of infected erythrocytes. Nat Commun. 2021 Jul 30;12(1):4711. doi: 10.1038/s41467-021-25062-z. PMID: 34330920; PMCID: PMC8324851
- Traore K, Bull* S, Niare A, Konate S, Thera MA, Kwiatkowski D, et al. Understandings of genomic research in developing countries: a qualitative study of the views of MalariaGEN participants in Mali. BMC Med Ethics 2015; 16 (1):42.
- Traore K, Lavoignat A, Bonnot G, Sow F, Bess GC, Chavant M, et al. Drying anti-malarial drugs in vitro tests to outsource SYBR green assays. Malar J. 2015;14(1):90.
Other staff
| Junior Scientists | Biologists / Lab Technicians Data Manager Admin & Financial Manager Drivers |
Field Workers Support Staff |
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Bouréma Guindo, MD, MSc candidate Bourama Tangara, MD, MSc candidate Ali Thera, MD, MSc candidate Aïchatou Diawara, MD, MSc candidate Mohamed Cissé, MD, MSc candidate Astou Diallo, PharmD, MSc candidate Moctar Coulibaly, MD Amidou Traoré, MD Souleymane Traoré, MD Kindié Kouriba, MD |
Biologists / Lab Technicians Fayçal Maïga, BSc Ladji Diarrassouba, BSc Data Manager Ibrahima Kébé, MSc Administrative and Financial Manager Sékouba Mariko, MBA Drivers Abinem Doumbo Moussa Niaré |
Field Workers Boucari Djiguiba Abdoulaye Ouologuem Paul Dougnon Harouna Doumbia Rokia Traoré Halima Coulibaly Support Staff Issa Tapily Sadio Dolo Saidou Karembé Domo Ouologuem Ampouroli Dougnon Soliba Koroma |
Organizational chart
